Ja, ich empfehle nach wie vor Truecrypt dafür.
Eine komplett verschlüsselte Platte anlegen (nicht nur Partiton(en) darauf) und fertig.
Dazu bei der Auswahl direkt auf "Harddisk 0/1/2" klicken, und nicht auf das "\Device\Harddisk0\Partition0" darunter (oder ähnlich). Anhand der Größenangabe nochmals checken, ob man die richtige ausgewählt hat.

Dauert bei 40GB vielleicht ne Stunde, je nach dem wie schnell die HDD ist.