Das lässt sich nicht vermeiden, wenn man anständige Qualität will.
Natürlich kann man die einzelnen Clips zwischendurch schon mit Xvid encoden um Platz zu sparen, aber da man sie dann am Ende erneut encodiert hat man nur einen unnötigen qualitätsvermindernden Schritt zwischendrin.
Warum er allerdings Vegas und After Effects nutzt versteh ich nicht ganz, eigentlich sollten beide Tools den benötigten Funktionsumfang haben. Wichtig is eben, dass man Clips beim ändern der Framerate resamplen kann und nicht nur einfach Framedrop betrieben wird.
Beim Arbeiten mit solch großen Datenmengen ist übrigens ne 2. physikalische Platte ganz angenehm, die dazu noch leer ist.